Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI43

MRM2, rRNA methyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRM2Q9UI43 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRM2Q9UI43 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms