Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms