Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC33■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC33■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms