Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms