Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
MBD5Q9P267 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
MBD5Q9P267 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
MBD5Q9P267 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
MBD5Q9P267 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
MBD5Q9P267 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
MBD5Q9P267 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
MBD5Q9P267 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
MBD5Q9P267 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
MBD5Q9P267 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
MBD5Q9P267 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
MBD5Q9P267 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
MBD5Q9P267 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
MBD5Q9P267 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
MBD5Q9P267 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
MBD5Q9P267 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
MBD5Q9P267 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
MBD5Q9P267 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
MBD5Q9P267 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
MBD5Q9P267 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
MBD5Q9P267 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC31.64■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
MBD5Q9P267 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms