Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms