Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms