Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMOD4Q9NZQ9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
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TMOD4Q9NZQ9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
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