Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ08

ERAP1, Endoplasmic reticulum aminopeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERAP1Q9NZ08 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERAP1Q9NZ08 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERAP1Q9NZ08 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms