Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms