Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DLL3Q9NYJ7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms