Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms