Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MTMR4Q9NYA4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms