Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKN2AIPQ9NXV6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms