Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHBDL2Q9NX52 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHBDL2Q9NX52 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHBDL2Q9NX52 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHBDL2Q9NX52 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHBDL2Q9NX52 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHBDL2Q9NX52 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHBDL2Q9NX52 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RHBDL2Q9NX52 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHBDL2Q9NX52 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHBDL2Q9NX52 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHBDL2Q9NX52 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHBDL2Q9NX52 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHBDL2Q9NX52 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHBDL2Q9NX52 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHBDL2Q9NX52 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHBDL2Q9NX52 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHBDL2Q9NX52 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHBDL2Q9NX52 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHBDL2Q9NX52 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHBDL2Q9NX52 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHBDL2Q9NX52 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RHBDL2Q9NX52 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHBDL2Q9NX52 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHBDL2Q9NX52 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHBDL2Q9NX52 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHBDL2Q9NX52 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHBDL2Q9NX52 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms