Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms