Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM140Q9NV12 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms