Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TDP1Q9NUW8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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