Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
PDS5BQ9NTI5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.7 ms