Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ATG3Q9NT62 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms