Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF275Q9NSD4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms