Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT82Q9NSB4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT82Q9NSB4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms