Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KRT84Q9NSB2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
KRT84Q9NSB2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
KRT84Q9NSB2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KRT84Q9NSB2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KRT84Q9NSB2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KRT84Q9NSB2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KRT84Q9NSB2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KRT84Q9NSB2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KRT84Q9NSB2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
KRT84Q9NSB2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KRT84Q9NSB2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KRT84Q9NSB2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KRT84Q9NSB2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KRT84Q9NSB2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KRT84Q9NSB2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRT84Q9NSB2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRT84Q9NSB2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRT84Q9NSB2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRT84Q9NSB2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRT84Q9NSB2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRT84Q9NSB2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRT84Q9NSB2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRT84Q9NSB2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRT84Q9NSB2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KRT84Q9NSB2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRT84Q9NSB2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRT84Q9NSB2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRT84Q9NSB2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRT84Q9NSB2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRT84Q9NSB2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRT84Q9NSB2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRT84Q9NSB2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT84Q9NSB2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT84Q9NSB2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms