Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNNM1Q9NRU3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms