Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE2

TSHZ2, Teashirt homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHZ2Q9NRE2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSHZ2Q9NRE2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSHZ2Q9NRE2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSHZ2Q9NRE2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSHZ2Q9NRE2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSHZ2Q9NRE2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSHZ2Q9NRE2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSHZ2Q9NRE2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSHZ2Q9NRE2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSHZ2Q9NRE2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSHZ2Q9NRE2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
TSHZ2Q9NRE2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
TSHZ2Q9NRE2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TSHZ2Q9NRE2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TSHZ2Q9NRE2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSHZ2Q9NRE2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSHZ2Q9NRE2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms