Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARHGEF4Q9NR80 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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