Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF3Q9NR23 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms