Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CD163L1Q9NR16 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms