Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms