Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERVK-5Q9HDB9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms