Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRMS1Q9HCU9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BRMS1Q9HCU9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms