Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms