Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCK5

AGO4, Protein argonaute-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGO4Q9HCK5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AGO4Q9HCK5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGO4Q9HCK5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AGO4Q9HCK5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGO4Q9HCK5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGO4Q9HCK5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGO4Q9HCK5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGO4Q9HCK5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGO4Q9HCK5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGO4Q9HCK5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGO4Q9HCK5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGO4Q9HCK5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGO4Q9HCK5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGO4Q9HCK5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGO4Q9HCK5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGO4Q9HCK5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGO4Q9HCK5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGO4Q9HCK5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGO4Q9HCK5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGO4Q9HCK5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGO4Q9HCK5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGO4Q9HCK5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGO4Q9HCK5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGO4Q9HCK5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGO4Q9HCK5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGO4Q9HCK5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGO4Q9HCK5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGO4Q9HCK5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGO4Q9HCK5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGO4Q9HCK5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGO4Q9HCK5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms