Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNRC6CQ9HCJ0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms