Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F5

CCDC86, Coiled-coil domain-containing protein 86, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86Q9H6F5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC86Q9H6F5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC86Q9H6F5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC86Q9H6F5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC86Q9H6F5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC86Q9H6F5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC86Q9H6F5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC86Q9H6F5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC86Q9H6F5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC86Q9H6F5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC86Q9H6F5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC86Q9H6F5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC86Q9H6F5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC86Q9H6F5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC86Q9H6F5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC86Q9H6F5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC86Q9H6F5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC86Q9H6F5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC86Q9H6F5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC86Q9H6F5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC86Q9H6F5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms