Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM12Q9H4Q4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms