Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NXF3Q9H4D5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms