Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SENP6Q9GZR1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SENP6Q9GZR1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms