Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CIPCQ9C0C6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms