Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM5Q9C035 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms