Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BCO2Q9BYV7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms