Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIFKQ9BYG3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms