Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHANK3Q9BYB0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms