Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM14BQ9BX40 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM14BQ9BX40 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms