Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2AFJQ9BTM1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
H2AFJQ9BTM1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2AFJQ9BTM1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2AFJQ9BTM1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2AFJQ9BTM1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2AFJQ9BTM1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2AFJQ9BTM1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2AFJQ9BTM1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2AFJQ9BTM1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2AFJQ9BTM1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2AFJQ9BTM1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2AFJQ9BTM1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2AFJQ9BTM1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2AFJQ9BTM1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
H2AFJQ9BTM1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2AFJQ9BTM1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2AFJQ9BTM1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2AFJQ9BTM1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2AFJQ9BTM1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2AFJQ9BTM1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2AFJQ9BTM1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2AFJQ9BTM1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2AFJQ9BTM1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2AFJQ9BTM1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2AFJQ9BTM1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2AFJQ9BTM1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2AFJQ9BTM1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2AFJQ9BTM1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2AFJQ9BTM1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2AFJQ9BTM1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
H2AFJQ9BTM1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2AFJQ9BTM1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms