Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
THUMPD2Q9BTF0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms