Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT11Q9BT88 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms