Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPK3BQ9BT76 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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