Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms