Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RETNLBQ9BQ08 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms